Hai capito giusto: le uova "molli" sono in realtà uova il cui guscio non ha avuto il tempo di formarsi, perché la gallina le ha espulse troppo presto. Gli sono "scappate". E' per questo che le trovi a terra e non nel nido.
E' vero che anche una carenza di calcio (molto improbabile su delle galline a terra) potrebbe provocare un problema simile, ma se scarseggia il calcio l'uovo segue la sua naturale crescita, e viene espulso a tempo debito, nel nido. Tu invece le trovi in giro, quindi il problema non è che l'uovo non ha la sostanza per formarsi, ma che esce troppo presto.
Il che appunto è normale che succeda sulle galline giovani o vecchie, ma non dovrebbe succedere se non sporadicamente a una gallina adulta. In tutti i casi comunque non si può fare niente: sarebbe uno di una serie di problemi all'ovidotto che non si possono curare.