Le macchie tondeggianti potrebbero essere imputabili al fungo
Diplocarpon mespili: la conferma si avrebbe se entro la macchia si scorgessero piccoli corpiccioli scuri (acervuli) che liberano le spore del patogeno che microscopicamente sono inconfondibili.
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Per quanto riguarda le escrescenze non riesco a distinguere anche perché le foto si vedono di fianco; al momento ti posso dire che non è detto siano di origine patologica, infatti possono infatti essere i c.d.
burr knots, cioè abbozzi radicali (vd. foto da rete su melo e altra su mio rosmarino)