E' senz'altro possibile che si tratti di rugginosità dovute al tripide degli agrumi,
Heliothrips haemorrhoidalis, oppure al tripide di Kelly: nel caso propenderei per il primo in quanto il secondo provoca rugginosità essenzialmente attorno alla zona peduncolare. Adesso non ne troveresti perché sarebbero a nanna riparati nelle screpolature della corteccia (il secondo è stato trovato anche presente in forma attiva in inverno sulle infiorescenze di viburno tino in Apulia).
Non so se per
H. haemorrhoidalis valga il detto
nomen omen, certo è che quando è in attività trofica sporca la pg. inferiore delle foglie con copiosi escrementi catramosi, per cui se ci fosse sul tuo limone alla ripresa primaverile te ne accorgeresti facilmente (forse potresti trovare ancora traccia di tali deiezioni nel caso di pregressa infestazione).
In alternativa si può prendere in considerazione un danno da vento (vd. foto e link) senza escludere del tutto gli acari (in particolare
Aculops pelekassi).
https://www.agric.wa.gov.au/citrus/thrips-citrus" target="_blank" target="_blank" target="_blank" target="_blank" target="_blank" target="_blank